在实际业务中，经常会发生入库数量小于发票数量的情况，即发生了在途损耗。对于这种在途损耗，要区分合理损耗和非合理损耗，进而采取不同的会计处理方法。会计制度规定：合理损耗是企业在经营过程中不可避免的，因而要计入存货的成本，其进项税额不得转出，只是提高了单个存货的成本；而非合理损耗是不可预知的，非正常的，这部分损失不得记入存货的成本，其进项税额要转出，这部分损失先在“待处理财产损溢”中归集，查明原因后，转入费用类科目。

一、在T3软件中存货的合理损耗操作如下：

       企业收到一张发票，数量10个，单价10元，金额100元，税额17元。实际入库8个，单价10元，金额80元，入库数量与发票数量相差的2个作为合理损耗处理。

1. 采购发票与采购入库单进行手工结算。

2. 因为相差的2个存货确认为合理损耗，系统会把10个存货的采购成本（发票金额）分摊到8个中。结算后，采购入库单上的单价提高。

3. 采购入库单记账后，通过购销单据制单和供应商往来制单生成相关的凭证即可。
二、在T3软件中存货的非合理损耗操作如下：
采购发票与采购入库单进行手工结算。

因为非合理损耗导致金额和增值税进项税额都需要转出（先在“待处理财产损溢--待处理流动资产损溢”科目终归集），所以采购入库的成本确认为80元，结算后的采购入库单的单价仍为10元。